La gastro-entérite est un trouble inflammatoire qui affecte à la fois l’estomac et l’intestin, d’où son nom. Elle se traduit généralement par une diarrhée aiguë, accompagnée de vomissements, de douleurs abdominales et parfois de fièvre. En termes médicaux, on parle d’atteinte de la muqueuse gastro-intestinale, c’est-à-dire de la couche interne qui tapisse l’estomac et les intestins. Lorsqu’une infection touche cette muqueuse, une réaction inflammatoire survient pour tenter d’éliminer l’agent pathogène (micro organisme à l’origine de la maladie).
Le mot "grippe intestinale" est souvent utilisé dans le langage courant pour décrire un ensemble de symptômes digestifs. Cette appellation populaire peut prêter à confusion, car il ne s’agit pas d’une grippe à proprement parler. Toutefois, l’expression évoque l’impact viral fréquemment associé à ce type de pathologie. Il existe en réalité plusieurs formes de gastro-entérite, qui diffèrent selon la cause. Les virus comme les rotavirus ou les norovirus sont très courants, mais des bactéries (par exemple, Escherichia coli) et même des parasites peuvent être impliqués.
En période d’épidémie de gastro-entérite, le risque de contagion est important. Les agents pathogènes se propagent rapidement. La transmission se fait souvent par voie oro-fécale : elle implique un contact avec des surfaces contaminées ou l’ingestion d’aliments ou d’eau souillée. Le plus souvent, les symptômes apparaissent après une courte phase d’incubation qui varie entre quelques heures et quelques jours, selon l’agent infectieux. Cette phase d’incubation correspond au laps de temps séparant l’infection de l’apparition des premiers signes cliniques.