La glycine est généralement bien tolérée, mais une consommation excessive peut entraîner des effets secondaires. Parmi les effets indésirables potentiels, on retrouve des troubles gastro-intestinaux tels que des ballonnements, des nausées ou des diarrhées.
Une consommation excessive de glycine peut également interférer avec l'absorption d'autres acides aminés, créant un déséquilibre dans l'organisme.
Chez certaines personnes sensibles, elle pourrait également provoquer une somnolence excessive si elle est prise en grande quantité avant une activité nécessitant de la vigilance. De plus, des interactions avec certains médicaments, notamment ceux régulant la glycémie ou la pression artérielle, sont possibles. Il est donc recommandé de consulter un professionnel de santé avant de commencer une supplémentation, en particulier pour les personnes souffrant de maladies chroniques, les femmes enceintes et allaitantes.